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2024-02-20

农学院赫圣博教授课题组揭示组蛋白H1通过相分离机制驱动异染色质浓缩

近日，华农学院赫圣博教授在The Plant Cell在线发表了题为“Linker histone H1 drives heterochromatin condensation via phase separation in Arabidopsis”的研究论文。文章报道了组蛋白H1通过相分离机制驱动植物异染色质浓缩。高等植物的染色质可大体上分为常染色质和异染色质。体细胞的常染色质富含基因，松散分布于细胞核内，为转录活跃区；而异染色质富含转座子，发生高度浓缩，为转录非活跃区，分布于细胞核的边缘。作者前期的工作揭示了精子常染色质浓缩的相分离机制（2022 Nature），而异染色质如何发生浓缩仍然未知。转座子通常处于非活性状态，其一旦激活发生跳跃，将破坏基因组稳定性。异染色质富含转座子，发生高度浓缩，在显微镜下呈现出清晰可见的浓缩结构，命名为异染色质浓缩斑(heterochromatin foci, HF)。植物利用多种表观遗传机制浓缩异染色质，抑制转座子激活。这些表观机制包括DNA甲基化、组蛋白修饰H3K9me2、异染色质浓缩因子（如ADCP1, MORC, H2A.W, H1）等。作者
2024-02-19

动物科学学院田铃教授团队发表腐生性资源昆虫黑水虻耐寒选育的阶段性工作进展

近日，环境科学与生态学知名期刊Waste Management（中科院一区，2023年IF：8.1）发表了动物科学学院田铃教授课组题名为“Selective breeding of cold-tolerant black soldier fly (Hermetia illucens) larvae: Gut microbial shifts and transcriptional patterns”的研究论文，该工作首次对黑水虻种质资源进行了收集、并进行了定向选育及其肠道优势菌群等的挖掘。黑水虻是重要的腐生性资源昆虫，几乎可以以所有有机废弃物为食，从而转化出高质量的昆虫蛋白及有机肥，其昆虫蛋白近年来受到了水产和畜禽养殖的广泛关注与使用。然而，目前商业黑水虻的养殖市场比较混乱，种质资源遗传背景及其生产性能差异不清楚，这些都限制了黑水虻资源的进一步开发与利用。因此，研究团队首先收集了10株国内黑水虻的商品种虫，经过COI基因测序比对之后实际划分为3组（图1），分别以生物源株、河南株、武汉株为代表。以优势株生物源株为基础，通过在12℃、16℃低温下连续筛选九代后，得到了一个相比对照组更耐低温
2024-02-08

园艺学院朱孝扬/李雪萍课题组揭示钙、脱落酸和乙烯信号互作调控番木瓜果实后熟机制

Normal07.8 磅02falsefalsefalseEN-USZH-CNX-NONE　　近日，植物学知名期刊Plant Biotechnology Journal（中科院一区，2023年IF：13.8）发表了园艺学院朱孝扬/李雪萍课题组题为“Calmodulin-like protein CML15 interacts with PP2C46/65 to regulate papaya fruit ripening via integrating calcium, ABA and ethylene signals”的研究论文。　　番木瓜（Carica papayaL.）是热带和亚热带地区一种深受消费者喜爱的水果，是仅次于香蕉、芒果和菠萝的第四大热带水果作物。其作为一种典型的呼吸跃变型果实，随着呼吸和乙烯高峰的出现，果实迅速转黄软化，导致贮藏期大大缩短，果实品质劣变迅速，这成为限制番木瓜产业发展的重要原因之一。钙离子作为一种多功能的信号离子，参与了植物和园艺作物的生长发育以及胁迫应答等各种过程。作为一种安全无毒的保鲜剂，外源钙处理可以有效地延缓果蔬的成熟和衰老，保持果蔬的品质，从而
2024-01-30

植物保护学院刘承兰教授课题组在农药残留环境生态风险评估研究取得新进展

近日，新葡的京集团350vip8888绿色农药全国重点实验室刘承兰教授课题组在国际知名环境期刊《危险材料杂志（Journal of Hazardous Materials）》（中科院1区，影响因子13.6）发表题为“Low-density polyethylene enhances the disturbance of microbiome and antibiotic resistance genes transfer in soil-earthworm system induced by pyraclostrobin”的研究论文（论文链接： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304389424000372?dgcid=author ）农药施用后不可避免会进入到土壤，而土壤同时是各种污染物如微塑料、重金属、农药等的“汇”。抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes, ARGs）作为一种新型生物污染物，对土壤生态系统安全和人体健康都造成严重威胁。但对于农药胁迫，尤其在微塑料共同污染下，是否影响土壤生态系统中
2024-01-27

园艺学院朱孝扬/李雪萍课题组在Plant and Cell Physiology发表封面论文揭示粉蕉果实成熟软化调控机制

　　1月21日，新葡的京集团350vip8888园艺学院/广东省果蔬保鲜重点实验室朱孝扬/李雪萍课题组在Plant and Cell Physiology上以封面文章发表了题为The Zinc Finger Protein MaCCCH33-Like2 Positively Regulates Banana Fruit Ripening by Modulating Genes in Starch and Cell Wall Degradation的研究论文，该论文也被选为同期编辑推荐论文。该研究揭示了锌指转录因子MaCCCH33-Like2调控粉蕉果实成熟软化的分子机制，为研发特色蕉粉蕉果实的贮藏保鲜新技术提供理论依据。　　粉蕉是一种重要的特色蕉，具有较好的非生物胁迫抗逆性和丰富的营养和独特的风味，深受消费者喜爱，在华南地区广泛种植。粉蕉具有典型的呼吸跃变特性，生产上要求粉蕉采收时果实饱满度高，果实成熟后才能表现出该品种所特有的品质和风味。与普通香芽蕉（AAA基因型）相比，粉蕉（ABB基因型）采后更易成熟和腐烂变质，贮藏期极短。研究表明，在果实淀粉的分解和乙烯合成方面，粉蕉和香芽蕉有很大不同，粉蕉具有更为
2024-01-15

生命科学学院周海/庄楚雄团队再次克隆调控不育起点温度的新基因

两系杂交水稻比传统的三系杂交水稻更能充分利用杂种优势。目前95%以上的两系杂交水稻的不育系是利温敏雄性不育基因tms5育成。温敏雄性不育的不育起点温度（critical sterility-inducing temperature，CSIT）是指雄性育性从可育转变为不育的临界温度，不同的温敏不育系具有不同的不育起点温度。然而，许多温敏核雄性不育的不育起点温度偏高，在夏季杂交制种时偶遇低温天气可能导致温敏不育系自交结实，从而导致杂交制种失败，造成巨大的经济损失。此外，有些温敏不育系的不育起点温度随着繁殖代数增加而不断提高，产生了遗传漂移，最终不能应用于杂交制种。两系制种失败几乎每年都有发生，大规模发生时直接经济损失上亿元。所以，温敏不育系的不育起点温度偏高和遗传漂移是限制两系杂交水稻发展的主要瓶颈。2023年10月，生命科学学院周海/庄楚雄团队在Molecular Plant上发表了题为“The E3 ubiquitin ligase CSIT1 regulates critical sterility-inducing temperature by ribosome-associate
2024-01-15

生命科学学院王浩课题组发表HDA6表观调控ROP6表达和信号传导以及叶片细胞极性的新机制

　　1月12日，新葡的京集团350vip8888生命科学学院王浩教授团队联合中国科学院华南植物园在《New Phytologist》 (2023年IF: 9.4) 在线发表了题为“HDA6 modulates Arabidopsis pavement cell morphogenesis through epigenetic suppression of ROP6GTPase expression and signaling”的研究论文。该研究揭示了在拟南芥叶片表皮细胞的发育过程中，组蛋白去乙酰化酶HDA6表观调控小G蛋白ROP6介导的细胞骨架空间分布在叶表皮细胞极性建立与维系中的生物学功能和分子作用机制。　　植物叶表皮扁平细胞作为研究植物界细胞极性建立与形态发生复杂性的典型模型系统，展现呈现出如拼图般的形态特征。这种扁平细胞的镶嵌模式赋予了细胞抗拉伸的机械强度，从而维持维系叶表面结构的完整性和提供适应外界环境的能力。在植物发育过程中，与Rho相关的GTP分子开关（ROPs）及其下游信号通路对细胞极性的形成与维系发挥关键的生物学功能，但是对ROP的转录调控机制一直都尚未被研究和解析。本研究深入研究了组蛋白
2024-01-14

唐湘如教授团队在减缓香稻重金属污染的栽培调控方面取得新进展

　　近日，我校农学院唐湘如教授团队在环境科学与生态学领域国际著名期刊Journal of Hazardous Materials（中科院一区，影响因子13.6）上在线发表了题为“Substation of vermicompost mitigates Cd toxicity, improves rice yields and restores bacterial community in a Cd-contaminated soil in Southern China”的研究论文。　　土壤重金属污染严重影响了香稻的高产优质安全生产。该论文以华南地区代表性的香稻品种美香占2号为材料，研究了蚯蚓粪添加处理对镉污染土壤胁迫下的香稻产量、土壤理化和土壤微生物多样性等的影响。研究结果表明，蚯蚓粪的添加显著影响了土壤细菌群落的多样性和组成，增加了一些细菌门的相对丰度；改善了土壤化学性状，包括土壤pH值、有机碳、氮、钾、磷和土壤酶活性。蚯蚓粪的添加降低了香稻植株对镉的吸收和积累，缓解了镉胁迫对香稻的不利影响，显著提高了香稻的产量。论文研究结果为减缓香稻重金属污染的栽培调控技术研发和稻田重金属污染治理
2024-01-05

动物科学学院张哲/李加琪教授团队与国内外多团队合作的最新成果登上Nature Genetics

　　近日，猪禽种业全国重点实验室、国家生猪种业工程技术研究中心、广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室，新葡的京集团350vip8888动物科学学院张哲/李加琪教授团队与国内外多个团队合作在猪基因组学领域取得重要进展。由新葡的京集团350vip8888与丹麦奥胡斯大学、英国爱丁堡大学、美国农业部农业研究局（USDA-ARS）和中国农科院深圳基因组研究所等全球10个国家的50余个研究团队合作完成的PigGTEx项目研究论文“A compendium of genetic regulatory effects across pig tissues”（猪多组织遗传调控效应图谱）于2024年1月4日在线发表于国际顶级期刊《自然—遗传学》（Nature Genetics）。这是全球猪基因组学研究领域时隔8年再次登上《自然—遗传学》的研究成果，同时也是我国猪遗传育种领域第3篇发表于该刊物的论文。　　我国是猪肉生产和消费第一大国，2022年全年生猪出栏量达7亿头。鉴定猪重要经济性状的育种靶点，解析其遗传调控机制，研发配套技术并创新运用到实际育种中、培育突破性的中国特色新品种（系）是我们打好种业翻身仗的战略需求。　　这项研究中，研究团队
2024-01-05

陈乐天课题组揭示H2O2转运蛋白OsPIP2;6在防御稻瘟病中的重要功能

　　植物质膜内在蛋白（PIPs）是一类保守的水通道蛋白，通过转运小分子触发胁迫应激反应，帮助植物适应多种非生物胁迫（包括干旱、高盐和极端温度等）。最近的研究表明，PIPs也参与植物对病原体的防御过程，但其在植物响应病原体免疫应答中的具体功能还有待深入挖掘。　　近日，新葡的京集团350vip8888陈乐天课题组在The Crop Journal在线发表了题为“Global characterization of OsPIP aquaporins reveals that the H2O2 transporter OsPIP2;6 increases resistance to rice blast”的研究论文，作者分析了水稻（Oryza sativa）中11个OsPIPs的表达模式、亚细胞定位和H2O2转运能力，并以此锁定了水稻抗病重要蛋白OsPIP2;6，进而揭示其与OsPIP2;2形成转运复合体协同防御病原体的分子机制。　　通过亚细胞定位和蛋白共表达分析，研究者发现，OsPIP1s特异定位于内质网，而OsPIP2s则定位于内质网和质膜。但当OsPIP1与OsPIP2共表达时，OsPIP1的定位模式从内质
2024-01-04

植物保护学院荔枝病害研究团队发现植物抗病新蛋白

近日，我校植物保护学院荔枝病害研究团队在国际知名学术期刊Nature Communications在线发表了题为“A plant cell death-inducing protein from litchi interacts with Peronophythora litchi pectate lyase and enhances plant resistance”的研究论文。该研究报道了一个新的植物免疫正调控蛋白PlPeL1-interacting protein 1 (LcPIP1)，其及同源蛋白与SERK3/BAK1直接互作，正向调控植物免疫。该研究为植物抗病育种提供了新的靶点和遗传资源。植物病原体释放大量包括果胶裂解酶（Pectate lyase，PeLs）在内的细胞壁降解酶，破坏植物细胞结构从而帮助病原菌侵染，同时部分PeLs也能激活植物免疫。但迄今为止，PeLs与植物免疫相关蛋白之间的直接相互作用尚未被报道。研究团队鉴定了两个荔枝霜疫霉（Peronophythora litchii）致病关键的PeLs—PlPeL1和PlPeL1-like，并且证明PlPeL1和PlPe
2024-01-03

园艺学院夏瑞团队发表植物小RNA分析工具sRNAminer

12月30日，我校夏瑞团队在国际知名期刊Science Bulletin（IF：18.9）上在线发表了题为“sRNAminer: a Multifunctional Toolkit for Next-Generation Sequencing Small RNA Data Mining in Plants”的研究论文，该研究开发了一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer。小RNA广泛存在于植物中，对植物的生长发育和营养繁殖起至关重要的作用。目前已有多款植物小RNA分析工具，但大多数依赖于命令行环境，无法有效支持湿实验室研究人员对植物小RNA生物功能的深度探索。同时，当前的小RNA分析工具多集中在单一类型的小RNA分析上，且计算资源消耗较大，通常还需花费大量时间和精力来学习众多工具或脚本的使用并组成可用的流程以获得最终分析结果。该研究开发的多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化（图 1）。图1. sRNAminer软件整体功能概览01 sRNAminer功能总览sRNAminer包含了常用的植物小RNA数据分析功能（图2
2023-12-29

我校本科生论文被人工智能领域顶级学术会议录用

近日，我校数学与信息学院、软件学院2021级本科生尹商鉴，在黄沛杰和徐禹洪老师的指导下，撰写的论文“Uni-MIS: United Multiple Intent Spoken Language Understanding via Multi-view Intent-slot Interaction”被人工智能领域顶级学术会议AAAI-24 (The 38th AAAI Conference on Artificial Intelligence)录用。尹商鉴为论文第一作者，黄沛杰为通讯作者。AAAI是人工智能领域的顶级国际会议（中国计算机学会CCF-A类推荐国际会议），聚集了全球人工智能领域的专业人士，共同探讨人工智能发展前沿。AAAI-24将于2024年2月20日-27日在加拿大温哥华（Vancouver, Canada）召开。口语语言理解（Spoken language understanding, SLU）在以任务为导向的人机对话系统中发挥着至关重要的作用，其主要目的是构建一个语义框架，以封装用户的请求。在现实生活场景中，用户经常会在单个话语中表达多个意图，因此多意图SLU成为了
2023-12-25

章家恩教授团队在微塑料污染对生态系统多功能性影响研究方面取得新进展

近日，我校资源环境学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室、广东省现代生态农业与循环农业工程技术研究中心、农业农村部华南热带农业环境重点实验室章家恩教授团队的博士生刘自强在环境科学与生态学领域的国际著名期刊Environment International（中科院1区，影响因子 11.8）在线发表题为“Polyethylene microplastics alter soil microbial community assembly and ecosystem multifunctionality”的研究论文。自20世纪50年代以来，全球塑料制品的生产和消费以每年约4%的速度增长。由于大多数塑料制品（尤其是塑料包装材料）的使用寿命较短，只有16%的塑料会被再利用，而66%的塑料制品未经回收处理而被丢弃。塑料碎片化后，会形成尺寸小于5mm的微塑料。据估计，在我国，每年约有1.3×106吨的微塑料被释放到农田土壤，农田生态系统被认为是一个主要的“塑料库”。因此，探明微塑料在农田生态系统中的直接和间接影响及其生态风险已迫在眉睫。该论文利用中宇宙受控实验，揭示了土壤微塑料污染对作物-土壤系统多

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